サーバでコマンドを実行すると「shell-init: error retrieving current directory: getcwd: cannot access parent directories」エラー

原因はカレントディレクトリが既に存在しなくなっていることだった。 ターミナルで開いているディレクトリをWinSCPで削除し、その後コマンドを実行すると発生した。 存在するディレクトリにcdしてからコマンドを実行すると直った。

参考：

arika.org